【答案】  能源和物质资源的浪费、引起环境污染、农业成本高等  物质的循环再生，能量的多级利用  流向对人类最有益的部分  第一营养级  分解者  光能  无核膜包被的细胞核（或无成形的细胞核）  纤维素  酵母菌  无氧呼吸

【解析】本题考查生态系统，涉及生态系统的原理，能量流动的意义，能量流动的过程相关知识，意在考察考生对知识点的识记理解掌握程度。

（1）因为在1985年前，某地农村家作物秸秆都是当做燃料，而农户和家畜的粪便等均作为肥料直接施入农田，这样会造成环境污染，并且能量和物质资源的浪费，农业成本高等缺点。

（2）该生态工程中遵循了物质循环再生原理，因为秸秆中的物质和能量，猪鸡粪便中的物质也被重新利用，从而实现了能量的多级利用，提高了能量的利用率。这样该生态系统可以使生产者固定能量流向对人类最有益的部分。

（3）农作物是生产者，是第一营养级。蘑菇、蚯蚓及沼气池中的微生物属于生态系统组成成分中的分解者。各种生物利用的能量最终都是来自光能，因为都是直接或间接利用的生产者，而生产者利用的是太阳能。

（4）产生甲烷的微生物主要是甲烷细菌属于原核生物，而水稻是真核细胞，所以它们最大的区别是没有核膜包被的细胞核。

（5）植物秸秆主要是纤维素，微生物A能将秸秆水解葡萄糖，所以微生物A能产生水解纤维素的纤维素酶。能将葡萄糖发酵成为酒精的是酵母菌，利用的是酵母菌的无氧呼吸，酵母菌进行有氧呼吸产生的是二氧化碳和水，无氧呼吸产生的是酒精和二氧化碳。