【答案】  B、b  B、b  X  自由组合  A、a   常  AAXbxb、aaXBY  1/6

【解析】试题分析：由题意知，果蝇的眼色由A、a和B、b两对等位基因控制，A、B同时存在呈现紫色，因此紫眼的基因型为A  B  ；A存在、B不存在呈现红色，因此红眼的基因型为A  bb；A不存在，不论B是否存在都呈现白色，因此白眼的基因型为aa ；

（1）F1中雌性全为紫眼，紫眼雌果蝇同时含有A、B基因，雄性全为红眼，红眼雄果蝇含有A、不含有B基因，紫眼和红眼的差异主要由B、b基因引起，且B只存在于雌果蝇中，所以可先确定B、b位于X染色体上，又由F2各性状的比例可知，两对相对性状的遗传遵循自由组合定律，因此A、a基因位于常色体上。

（2）由于基因A、a位于常染色体上，基因B、b位于X染色体上，亲本红眼雌果蝇的基因型是AAXbXb，白眼雄果蝇的基因型是aaXBY，杂交子一代的基因型是AaXBXb、AaXbY，F2红眼果蝇中基因型以及比例为AAXbXb：AAXbY：Aa XbXb：Aa XbY=1：1：2：2，其中AAXbXb为雌性纯合子，因此红眼果蝇中雌性纯合子占1/6.