【答案】B

【解析】

本题考查遗传的基本规律、基因突变、遗传的分子基础和细胞学基础，考查对等位基因概念的理解，解答此题，可根据等位基因的含义和来源判断其根本区别。

豌豆的高茎基因与矮茎基因属于等位基因，它们控制同一性状的不同表现类型，A项错误；等位基因是通过基因突变产生的，它们之间的根本区别在于脱氧核苷酸的排列顺序不同，B项正确；遗传密码位于mRNA上，C项错误；等位基因位于同源染色体的同一位置上，D项错误。